La carrera profesional de Sertan Eser se extiende desde 2006 hasta 2011, un periodo de aproximadamente 5 temporadas en el que ha acumulado 77 partidos repartidos entre 3 clubes. Con 17 goles y 0 asistencias registradas en ese tramo, su trayectoria refleja una contribución sostenida al máximo nivel.
Su mejor temporada en términos de producción ofensiva llegó en 06/07 con el İstanbul Başakşehir, cuando sumó 10 goles y 0 asistencias en 30 partidos, disputando 2509 minutos. Esa campaña marcó uno de los puntos más altos de su rendimiento.
En su temporada más reciente registrada (10/11) en el Sakaryaspor, Sertan Eser disputó 19 partidos, anotando 4 goles y repartiendo 0 asistencias.