La carrera profesional de Jonathan Mejía Ruiz se extiende desde 2013 hasta 2023, un periodo de aproximadamente 10 temporadas en el que ha acumulado 246 partidos repartidos entre 7 clubes. Con 74 goles y 1 asistencias registradas en ese tramo, su trayectoria refleja una contribución sostenida al máximo nivel.
Su mejor temporada en términos de producción ofensiva llegó en 14/15 con el Cádiz, cuando sumó 39 goles y 0 asistencias en 72 partidos, disputando 2620 minutos. Esa campaña marcó uno de los puntos más altos de su rendimiento.
En su temporada más reciente registrada (22/23) en el Torre del Mar, Jonathan Mejía Ruiz disputó 10 partidos, anotando 1 goles y repartiendo 0 asistencias.
Entre los hitos destacados de su trayectoria, Jonathan Mejía Ruiz ha superado la barrera de los 200 partidos profesionales y acumula 74 goles en su carrera.