La carrera profesional de Johan Bonilla se extiende desde 2022 hasta 2026, un periodo de aproximadamente 4 temporadas en el que ha acumulado 103 partidos repartidos entre 4 clubes. Con 14 goles y 3 asistencias registradas en ese tramo, su trayectoria refleja una contribución sostenida al máximo nivel.
Su mejor temporada en términos de producción ofensiva llegó en 22/23 con el Grecia, cuando sumó 9 goles y 0 asistencias en 31 partidos, disputando 1669 minutos. Esa campaña marcó uno de los puntos más altos de su rendimiento.
En su temporada más reciente registrada (25/26) en el Gzira United, Johan Bonilla disputó 27 partidos, anotando 4 goles y repartiendo 0 asistencias.
Entre los hitos destacados de su trayectoria, Johan Bonilla ha superado la barrera de los 100 partidos profesionales.