La carrera profesional de Boštjan Cesar se extiende desde 2007 hasta 2020, un periodo de aproximadamente 13 temporadas en el que ha acumulado 353 partidos repartidos entre 2 clubes. Con 20 goles y 2 asistencias registradas en ese tramo, su trayectoria refleja una contribución sostenida al máximo nivel.
Su mejor temporada en términos de producción ofensiva llegó en 10/11 con el ChievoVerona, cuando sumó 3 goles y 0 asistencias en 32 partidos. Esa campaña marcó uno de los puntos más altos de su rendimiento.
En su temporada más reciente registrada (19/20) en el ChievoVerona, Boštjan Cesar disputó 21 partidos, anotando 0 goles y repartiendo 1 asistencias, con una valoración media de 6.87.
Entre los hitos destacados de su trayectoria, Boštjan Cesar ha superado la barrera de los 300 partidos profesionales.