La carrera profesional de Borja Prieto se extiende desde 2013 hasta 2025, un periodo de aproximadamente 12 temporadas en el que ha acumulado 332 partidos repartidos entre 5 clubes. Con 20 goles y 0 asistencias registradas en ese tramo, su trayectoria refleja una contribución sostenida al máximo nivel.
Su mejor temporada en términos de producción ofensiva llegó en 12/13 con el Real Avilés, cuando sumó 5 goles y 0 asistencias en 35 partidos. Esa campaña marcó uno de los puntos más altos de su rendimiento.
En su temporada más reciente registrada (24/25) en el L'Entregu, Borja Prieto disputó 7 partidos, anotando 1 goles y repartiendo 0 asistencias.
Entre los hitos destacados de su trayectoria, Borja Prieto ha superado la barrera de los 300 partidos profesionales.