A carreira profissional de Marko Babic se estende de 2006 a 2013, um período de cerca de 7 temporadas no qual acumulou 115 partidas distribuídos por 5 clubes. Com 10 gols e 0 assistências registrados nesse intervalo, sua trajetória reflete uma contribuição constante no mais alto nível.
Sua melhor temporada em produção ofensiva foi em 11/12 pelo Osijek, quando somou 3 gols e 0 assistências em 20 jogos, atuando por 1509 minutos. Essa campanha marcou um dos pontos mais altos de seu desempenho.
Em sua temporada mais recente registrada (12/13) no LASK Linz, Marko Babic disputou 6 partidas, marcando 0 gols e dando 0 assistências.
Entre os marcos de sua trajetória, Marko Babic ultrapassou a marca de 100 partidas profissionais.