A carreira profissional de Juan Aguilera se estende de 2016 a 2022, um período de cerca de 6 temporadas no qual acumulou 171 partidas distribuídos por 2 clubes. Com 5 gols e 0 assistências registrados nesse intervalo, sua trajetória reflete uma contribuição constante no mais alto nível.
Sua melhor temporada em produção ofensiva foi em 16/17 pelo Huesca, quando somou 3 gols e 0 assistências em 35 jogos, atuando por 2976 minutos. Essa campanha marcou um dos pontos mais altos de seu desempenho.
Em sua temporada mais recente registrada (21/22) no Alcorcón, Juan Aguilera disputou 23 partidas, marcando 0 gols e dando 0 assistências, com avaliação média de 6.43.
Entre os marcos de sua trajetória, Juan Aguilera ultrapassou a marca de 100 partidas profissionais.